همسانه سازی، شناسایی و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و روند تکامل ژنتیکی یک ژن تیوردوکسین h از گیاه انگور بیدانه سفید

نویسندگان

رضا حیدری چابلقی

رحیم حداد

قاسمعلی گروسی

چکیده

تیوردوکسین ها (trxs) پروتئین هایی کوچک و مقاوم در برابر حرارت هستند که در حفظ تعادل شرایط اکسیداسیون- احیاء (redox) سلولی دخالت داشته و در تمام موجودات زنده از پروکاریوت ها تا یوکاریوت های عالی وجود دارند. در گیاهان عالی، تیوردوکسین ها به شش گروه مختلف، شامل تیوردوکسین های کلروپلاستی f،m ،x و y، تیوردوکسین میتوکندریایی o و تیوردوکسین های h تقسیم بندی می شوند. تیوردوکسین های h با داشتن یک خانواده چند ژنی کوچک در فرآیندهای متعددی از جمله محافظت سلولی در برابر تنش اکسنده دخالت می کنند. cdna کدکننده ژن تیوردوکسین h (vvtrxh3) از بافت برگ گیاه انگور بیدانه سفید (vitis vinifera l. bidaneh sefid)، با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره ای پلی مراز نسخه برداری معکوس (rt-pcr) جداسازی و همسانه سازی شده و خصوصیات بیوشیمیایی، ساختاری و روند تکامل ژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. بررسی توالی نوکلئوتیدی نشان داد که چارچوب باز خواندنی ژن همسانه سازی شده vvtrxh3 به طول bp345 بوده و یک پروتئین با 114 اسیدآمینه را کد می کند. همچنین بررسی توالی پروتئینی این ژن نشان داد که جایگاه فعال آن به صورت wcgpc بوده و وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه آیزوالکتریک پیش بینی شده آن به ترتیب برابر 79/12 کیلودالتون و 06/5 و دارای ساختار سه بعدی مختص پروتئین های تیوردوکسین، تحت عنوان thioredoxin fold می باشد. بررسی های فیلوژنتیکی و همردیف سازی چندگانه نشان داد که این ژن، تیوردوکسین نوع h و متعلق به زیرکلاس ia از زیرگروه i بوده و شباهت زیادی با تیوردوکسین های h گیاهان دیگر دارد.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

همسانه سازی ژن تیوردوکسین h از گیاه انگور (.vitis vinifera l)

تیوردوکسین ها (trxs) پروتئین های کوچکی هستند که به فراوانی در تمام موجودات زنده از پروکاریوت ها تا یوکاریوت های عالی یافت می شوند. آنها از طریق دو اسید آمینه سیستئین موجود در جایگاه فعالشان در واکنش های تیول- دی سولفید شرکت کرده و قادر به احیاء پیوندهای دی سولفید در پروتئین های هدف می باشند. تیوردوکسین ها براساس ساختارهای اولیه پروتئینی و نحوه قرارگیری در اندامک های سلولی، به گروه ها و زیر گروه...

15 صفحه اول

همسانه سازی و تعیین خصوصیات ژن زیر واحد c آنزیم H+- ATPase واکوئلی در گیاه هالوفیت Aeluropus littoralis

سابقه و هدف : مدیریت جذب، انتقال، تبادل و کده بندی کردن یون ها و تنظیم دقیق نسبت های یونی در گیاهان به واسطه فعالیت مجموعه ای از ناقل ها، حامل ها و کانال های یونی صورت می پذیرد . پمپ یونی H+-ATPase واکوئلی، نقش مهّمی در ایجاد و حفظ شیب الکتروشیمیایی دارد و انتقال یون ها به داخل واکوئل سلول های گیاهی را تحت تأثیر قرار می دهد . فعالیت این پمپ باعث ایجاد نیروی محرکه پروتونی اولیه برای راه اندازی و ...

متن کامل

شناسایی، همسانه سازی و تحلیل ساختار ژن تیوردوکسین vvtrxh10) h )جدا شده از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی

جهت بررسی ساختار ژن تیوردوکسین، rna کل از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیره­ای پلیمراز نسخه برداری معکوس(rt-pcr) ، کتابخانه cdna تهیه گردید. سپس ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh10 سنتز، جداسازی و در ناقل پلاسمیدی puc19 همسانه سازی شد. نتایج توالی­یابی نشان داد که قطعه همسانه سازی شده از ژن تیوردوکسین h حاوی یک چارچوب قرائت آزاد منفرد به طولbp...

متن کامل

شناسایی، همسانه سازی و تحلیل ساختار ژن تیوردوکسین vvtrxh۱۰) h )جدا شده از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی

جهت بررسی ساختار ژن تیوردوکسین، rna کل از بافت حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی استخراج و با استفاده از روش واکنش زنجیره­ای پلیمراز نسخه برداری معکوس(rt-pcr) ، کتابخانه cdna تهیه گردید. سپس ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh10 سنتز، جداسازی و در ناقل پلاسمیدی puc19 همسانه سازی شد. نتایج توالی­یابی نشان داد که قطعه همسانه سازی شده از ژن تیوردوکسین h حاوی یک چارچوب قرائت آزاد منفرد به طولbp...

متن کامل

همسانه سازی cdna ژن تیوردوکسین vvtrxh) h) از بافت حبه انگور رقم یاقوتی (vitis vinifera l. cv. yaquti)

تیوردوکسین ها پروتئین هایی فراگیر و از لحاظ وزن مولکولی کوچک (معمولا شامل 100 تا 120 آمینو اسید) بوده و دارای پل دی سولفیدی انفعالی با توالی های کاملا حفاظت شده - –cys- gly (ala/pro)- pro- cys می باشند. در این تحقیق، پس از استخراج rna کل ازبافت های برگ و حبه انگور (vitis vinifera l.) رقم یاقوتی، سنتز cdna ازrna استخراجی صورت پذیرفت. ژن تیوردوکسین h تحت عنوان vvtrxh ، با استفاده از تکنیک واکنش ز...

15 صفحه اول

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
علوم باغبانی ایران

ناشر: پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

ISSN 2008-482X

دوره 43

شماره 2 2012

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023